從理論上講，分稅制財政體制能夠成功運行的一個基本要求，是各級政府有自己的主體收入，用自己的財力辦自己的事情。當前體制采取的財力層層上劃，然后再通過大規(guī)模的縱向轉移支付解決地方財力缺口的做法，一定程度上會使地方政府逐步增強對上級政府的依賴。因此，完善分稅制財政體制，解決基層財政的實際困難，核心是確立一級財政，并使這級財政擁有能夠基本滿足自己需要的自主財力，再輔之以一定的轉移支付財力，這樣才能做到自己的事情自己辦。
財權與事權的統(tǒng)一，是分稅制財政體制正常運行的又一基本要求。從現(xiàn)在的發(fā)展趨勢看，一是中央財政的職責重大，如保持國民經濟的持續(xù)穩(wěn)定發(fā)展，促進區(qū)域經濟協(xié)調發(fā)展，發(fā)展高等教育、尖端科技和高新產業(yè)，全國性的環(huán)境保護，江河湖泊的治理等，中央財政必須要有強大的財政調控能力。分稅制體制實施之后的10多年間，逐步提高了中央財政收入占全國財政收入的比重，符合中央財政的財權和事權相對稱原則。但同時需要注意的是，我國長期實行的是城鄉(xiāng)分離的社會經濟體制，“二元結構”非常明顯。結果是隨著社會主義市場經濟的發(fā)展，公共財政提供公共服務時在城鄉(xiāng)與區(qū)域之間存在著一定的非均等化。因此，我國今后要實現(xiàn)城鄉(xiāng)社會經濟協(xié)調發(fā)展，在廣大農村，財政在供給公共產品方面要彌補歷史的欠賬和滿足新的公共需求，如提供農村社會保障，提高農村醫(yī)療衛(wèi)生條件等，由此，基層財政的任務是非常巨大的。
新公共管理改革的理論中提倡的“扁平化”理念可以被我們的財政體制改革所借鑒。目前，我國實行的是五級財政體制，從運行的情況看可以發(fā)現(xiàn)存在一些值得注意的問題：一是由于財政層次過多，影響了各級財政主體收入體系的形成；二是由于財政層次過多，影響了各級財政的事權劃分和職責的確立。這種情況影響了分稅制財政體制正常運行，也是導致基層財政困難的主要原因之一。從目前的情況來看，已經開始實行的取消鄉(xiāng)鎮(zhèn)財政，實行鄉(xiāng)財縣管以及取消市級（地級市）財政對縣級財政的管理，實行省級財政直接管理縣級財政的改革，效果是比較明顯的。這樣一來，全國的財政級次變?yōu)槿?，即中央、?。ㄊ?、自治區(qū)）和縣（地級市、縣級市）?？h級財政成為基層財政，一方面可以減少因為層級過多造成的漏損，另一方面也增強了中央和省級財政的調控能力。所以，完善目前的分稅制財政體制，要增加縣級財政的主體稅種，擴大稅收分享中縣級財政分享的比例，使縣級財政成為真正獨立的一級財政，充分發(fā)揮其基層財政應有的作用。
按照公共財政和城鄉(xiāng)一體原則繼續(xù)改革農業(yè)財稅制度
公共財政改革的目標之一就是在廣大農村建立與城鎮(zhèn)無差別的公共服務體系，實現(xiàn)基本公共服務的均等化。農村的許多公共產品，如基礎設施、教育、社會保障等，不僅在屬性上與城市公共產品是一樣的，而且許多公共產品的受益范圍不局限于農村居民，甚至城市居民的受益還要大于農村居民的受益。因此，在供給的方式上也應該采取相同的政策。但現(xiàn)在在公共產品的供給上，存在較大區(qū)別，農村的公共產品主要由農民自己負擔。這種厚此薄彼的公共產品供給政策，必然造成城鄉(xiāng)居民發(fā)展機會的不均等。所以，要加大對農村公共產品的供給力度，尤其是目前農村的義務教育、醫(yī)療衛(wèi)生、養(yǎng)老救濟等急迫需要的公共產品，要逐步納入全國統(tǒng)一的公共產品供給體系，以逐步縮小城鄉(xiāng)差別，實現(xiàn)城鄉(xiāng)社會經濟的一體化發(fā)展。
需要注意的問題是，在我國現(xiàn)行的財政支出政策體系中，財政與農業(yè)的關系，主導的觀念是財政支農。而事實上這一理念與發(fā)展社會主義市場經濟的要求是不一致的。在社會主義市場經濟條件下，無論國有經濟，還是集體經濟、個體經濟或者私營經濟，都是市場經濟的活動主體，都有義務按照國家統(tǒng)一稅法的規(guī)定，積極主動地向國家納稅，同時也有權利享受國家向社會成員提供的公共產品與服務。因此，不能再按照不同的產業(yè)和不同的社會群體來制定不同的財政政策。其實，隨著社會主義市場經濟的發(fā)展，我國的財政政策已逐步從區(qū)別性的政策走向共同性的政策，如增值稅的轉型、統(tǒng)一企業(yè)所得稅、全面開征個人所得稅、財政支出逐步退出一般競爭性領域等。所以，隨著經濟的發(fā)展，今后我國農民應該和城市居民一樣同等地享受經濟發(fā)展帶來的由國家財政提供的各種社會福利，這就必然要求徹底拋棄帶有區(qū)別性的財政支農觀念。
目前，我國實行的農村稅費改革，其主要目標是減輕農民負擔，規(guī)范農村分配關系，遏制農村“三亂”現(xiàn)象的發(fā)生。從實現(xiàn)我國城鄉(xiāng)經濟的協(xié)調發(fā)展和建立公共財政體制的目標出發(fā)，還必須繼續(xù)深化農業(yè)財政稅收制度改革。首先，應加大公共財政對農業(yè)“一般服務支持”的力度。借鑒國外的先進經驗，重點扶持農業(yè)基礎設施建設、農業(yè)科研、教育和推廣體系建設，同時提高市場信息服務水平，對農業(yè)合作組織的發(fā)展予以引導和支持。其次，切實解決好鄉(xiāng)村債務問題。要制止鄉(xiāng)村新債的發(fā)生，有計劃、有步驟地推進農村債務化解工作，這是解決好基層政府困難的關鍵所在。第三，進一步加快城鄉(xiāng)稅制一體化改革進程。按照科學發(fā)展觀的要求，以建立和諧稅收為近期的目標，秉承有利于農業(yè)循環(huán)經濟、可持續(xù)發(fā)展的思路，切實減輕農民負擔，尤其是間接的負擔。必須對城鄉(xiāng)居民實行同等的稅收優(yōu)惠政策，妥善處理農業(yè)生產資料的稅收優(yōu)惠政策，加大對經濟欠發(fā)達農村地區(qū)的稅收扶持。從長期來看，在借鑒各國經驗的基礎上，逐步建立起一個包括貨物和勞務稅、所得稅、財產稅在內的城鄉(xiāng)統(tǒng)一的新稅制。
