“在推進國庫集中支付改革的過程中，我們按照改革的內在要求，調整財務機構設置，取得了很好的效果?！苯煌ú控攧账居嘘P負責人介紹說。幾年來，交通部理順財務管理體制，積極推進國庫集中支付改革，保障了部屬單位正常運轉經費和交通建設用款，促進了交通事業(yè)的發(fā)展。
交通部財務管理有幾大特點，一是預算級次多（五級）；二是涉及單位多，僅直屬單位就有347家；三是資金種類多，包括車購稅交通專項資金、港口建設費政府性基金等；四是特殊情況多，交通部直屬行政事業(yè)單位，且所屬單位跨多個省市，行業(yè)特征十分突出。因此，各單位在預算管理和財務管理上都存在一些各自的特殊要求，統(tǒng)一的規(guī)定很難滿足全部需要。
針對以上特點，交通部制定了一整套的辦法。第一，理順財務管理體制。交通部直屬行政事業(yè)單位實行“統(tǒng)一領導、分級管理”的預算管理和財務管理體制。對于納入交通部部門預算，由中央交通專項資金安排的地方交通建設項目，交通部從行業(yè)管理的角度強化了行業(yè)財會主管部門指導、協調、服務和監(jiān)督的綜合管理職能，明確了各級預算單位財務管理和資金監(jiān)管職責。第二，建立規(guī)章制度。交通部加大交通財會規(guī)章制度的建立和完善工作，配合財政部或單獨組織修訂和制定預算管理、國庫集中支付、資金監(jiān)督、會計核算等一系列相關管理辦法。第三，調整機構設置。將過去按公路、水運、事業(yè)行業(yè)對口設置財務司內部處室的做法，調整為按財務和會計的核算和管理流程設置財務司內部處室。目前設置了綜合處、預算管理處、總會計處和資產管理處共四個處室，總會計處主要負責辦理國庫集中支付業(yè)務。
交通部國庫集中支付改革試點工作7年來取得良好效果：一是針對改革工作制定了符合實際情況的管理辦法，明確了各方的具體職責，具有較強的操作性；二是在改革實施過程中，財政、交通部門密切配合，出現問題及時協調，提高了工作效率；三是各級預算單位分批改革，設置改革過渡期，減少了改革的阻力；四是國庫集中支付改革促進了預算編制真實性，杜絕了虛報冒領，提高了財政資金使用效率。
交通部車輛購置稅交通專項資金從2001年1月1日起，在全國6個?。ㄗ灾螀^(qū)）開始實行由財政部直接將資金撥付到項目單位的試點工作，2004年試點范圍擴大到17個?。ㄗ灾螀^(qū)、直轄市、計劃單列市），2006年擴大到全國所有?。ㄗ灾螀^(qū)、直轄市、計劃單列市）。
2005年1月1日，交通部部屬行政事業(yè)單位開始實行國庫集中支付改革，2007年10月1日,交通部所屬347個基層預算單位全部納入了國庫集中支付改革范圍。
