1994年稅制改革的重大意義在于：（1）初步理順了國家與企業(yè)的分配關(guān)系。稅制改革之前在國有企業(yè)盛行的“包稅制”，通過政府與企業(yè)一對一的談判，使分配關(guān)系極不穩(wěn)固，效益好的企業(yè)，把上繳利潤的一頭包死了，國家財政收入不能隨企業(yè)效益提高而增加，效益差的企業(yè)則“包盈不包虧”，嚴重扭曲了稅制，特別是一些地方和企業(yè)實行投入產(chǎn)出總承包，還包了流轉(zhuǎn)稅，動搖了財政收入的根基。稅制改革則以法制為基礎(chǔ)，規(guī)范了國家與企業(yè)的稅收分配關(guān)系，促進了國有企業(yè)經(jīng)營機制的轉(zhuǎn)換。（2）為實行分稅制創(chuàng)造了體制條件，進一步增強了中央財政實力。稅制是分稅制的基礎(chǔ)和重要組成部分，不建立健全稅制，就不可能進行分稅，因而不可能建立分稅制。通過稅制和分稅制改革的聯(lián)動推進，進一步理順了中央與地方的分配關(guān)系，為提高中央財政收入所占比重、增強財政宏觀調(diào)控能力奠定了堅實基礎(chǔ)。（3）使稅制更加公平、合理、有效，適應了經(jīng)濟發(fā)展對組織稅源的需要。我國正處于工業(yè)化快速發(fā)展的時期，工業(yè)是我國最重要的稅源基礎(chǔ)，為促進企業(yè)健康發(fā)展和培植稅源，對容易導致企業(yè)重復征收、重復建設(shè)的不合理的產(chǎn)品稅、工商統(tǒng)一稅實行重大改革，建立了以增值稅為核心，輔之以消費稅、營業(yè)稅的新流轉(zhuǎn)稅體系。同時，針對我國個人收入不斷增加、前景看好的情形，及時將個人收入調(diào)節(jié)稅、適用于外籍人員的個人所得稅和城鄉(xiāng)個體工商業(yè)戶所得稅合并，建立統(tǒng)一的個人所得稅制，為充分挖掘個人收入稅源潛力創(chuàng)造了有利條件。
1994年稅制改革的最大成效，就是初步建立了財政收入穩(wěn)定增長的機制。稅制改革后，稅收已成為財政收入最主要的來源。此后，我們又不斷地調(diào)整和完善稅制，特別是針對稅收征管體制滯后于稅制的狀況，加快了稅收征管改革步伐。一個健康有效的稅制，必須通過與之相適應的稅收征管制度來保證實施。1998年以來，進一步加強稅收法制建設(shè)，深化稅收征管體制改革和以“金稅工程”為主要手段的稅收征管信息網(wǎng)絡(luò)的建設(shè)運用，建立海關(guān)緝私警察制度，這對于加強稅收征管，打擊各種偷逃騙稅、走私等涉稅違法犯罪活動，發(fā)揮了重要作用。新《稅收征管法》及其《實施細則》等一批法律法規(guī)相繼頒布實施，稅收征管力度加強，保證了稅收持續(xù)大幅度增長。2002年全國稅收收入（此為國家統(tǒng)計局統(tǒng)計口徑，已沖減了出口退稅部分）比1993年增長了3.14倍，年均增長17.1％，與同期財政收入年均增長數(shù)基本同步，其中1994——1997年年均增收995億元，1998——2002年年均增收1880億元。稅制的重大改革和不斷完善，為持續(xù)大幅度增加財政收入、增強宏觀調(diào)控能力、支持經(jīng)濟和社會事業(yè)全面發(fā)展，作出了重要貢獻。
二、現(xiàn)行稅制存在的一些主要問題
必須看到，與發(fā)展社會主義市場經(jīng)濟和全面建設(shè)小康社會的要求相比，現(xiàn)行稅制還有許多不完善的地方。主要表現(xiàn)在
1.實行生產(chǎn)型增值稅抑制了企業(yè)投資的積極性。我國實行增值稅改革時，從當時控制投資規(guī)模膨脹的宏觀環(huán)境和保持稅負基本穩(wěn)定的需要出發(fā)，采用了國際上很少使用的生產(chǎn)型增值稅制。這種稅制只允許企業(yè)抵扣購進原材料所含進項稅金，不允許抵扣固定資產(chǎn)所含進項稅金，因而存在對資本品重復征稅的問題，影響了企業(yè)投資的積極性，制約了資本有機構(gòu)成高的企業(yè)和高新技術(shù)產(chǎn)業(yè)的發(fā)展。隨著我國社會投資自主增長的機制不斷得到增強，生產(chǎn)型增值稅制的弊端愈益顯現(xiàn)。
2.實行內(nèi)外資兩套企業(yè)所得稅制，在一定程度上抑制了內(nèi)資企業(yè)發(fā)展的積極性。改革開放以來，在國內(nèi)建設(shè)資金緊張的情況下，為了積極吸引外資加快經(jīng)濟發(fā)展，對外資實行一定的稅收優(yōu)惠政策是必要的，在實踐中發(fā)揮了重要作用。但是，隨著我國加入世貿(mào)組織和全方位擴大對外開放，繼續(xù)對外資實行稅收優(yōu)惠政策，有違WTO關(guān)于公平競爭的原則，不利于內(nèi)資企業(yè)健康發(fā)展，同時也是難以為繼的。
3.現(xiàn)行個人所得稅對調(diào)節(jié)個人收入差距的力度不夠。隨著個人收入水平不斷提高，個人所得稅起征點偏低問題突出，廣大工薪階層成為納稅的主體，而高收入者繳納稅收與其收入相比，很不相稱。特別是現(xiàn)行的分項按次征稅的個人所得稅制，存在很多弊端，許多高收入者只要采用“化整為零”的方法，就會輕易地使很多收入都達不到起征點，或是適用的稅率比較低，從而達到偷逃稅收的目的。此外，與個人所得稅配套的遺產(chǎn)稅制還沒有建立起來，弱化了對高收入者的調(diào)節(jié)力度。
4.以費代稅問題不容忽視。例如：目前交通和車輛收費管理中一個突出問題是收費負擔不合理，養(yǎng)路費等交通和車輛收費，基本上是按車輛噸位大小或座位個數(shù)征收，用車與不用車負擔不一樣，多用車與少用車負擔不一樣，沒有體現(xiàn)“多用路者多負擔，少用路者少負擔”的原則，造成社會負擔不均衡。而機動車輛消耗燃油或燃氣量的多少，與道路磨損程度基本成正比，對燃油或燃氣征稅，能夠體現(xiàn)“多用路、多負擔”的原則，比較公平、合理，但目前我國還沒有用燃油稅取代交通和車輛收費，這種狀況還加大了治理“三亂”現(xiàn)象的難度。又如：目前社會保險費主要由勞動部門征收，由于缺乏法律制約，無法解決強制性不夠、征收力度小、成本費用過高等問題，導致社會保障經(jīng)費來源不穩(wěn)固，這些都需要通過開征社會保障稅來解決。
