由于醫(yī)院成本核算的復(fù)雜性，各個科室的性質(zhì)不同，收入來源結(jié)構(gòu)不同，支出范圍不同，造成了醫(yī)院的成本核算很難有統(tǒng)一的標(biāo)準(zhǔn)，為了加強醫(yī)院的成本核算職能，全面推進(jìn)全成本核算，新的《醫(yī)院會計制度》在會計科目的設(shè)置上以及一些會計處理的規(guī)定上做出了相應(yīng)的調(diào)整，這些調(diào)整為醫(yī)院成本核算工作的順利開展和不斷進(jìn)步奠定了良好的基礎(chǔ)。
首先，新《醫(yī)院會計制度》提出了權(quán)責(zé)發(fā)生制的概念，這是借鑒企業(yè)會計所提出來的概念，對于事業(yè)單位來說，以往的成本核算多采用收付實現(xiàn)制，這雖然簡化了會計核算流程和方法，但是造成的結(jié)果就是收入成本不匹配，應(yīng)該在本期確認(rèn)收入成本的項目沒有在本期確認(rèn)，應(yīng)該在本期發(fā)生的支出和費用也沒有在本期發(fā)生，這就造成醫(yī)院當(dāng)期的收支是不配比的。引入了權(quán)責(zé)發(fā)生制以后，凡是當(dāng)期應(yīng)該確認(rèn)的收入和支出都必須在當(dāng)期確認(rèn)，使得醫(yī)院的成本核算更加規(guī)范科學(xué)，為醫(yī)院的成本核算打下了一個堅實的理論基礎(chǔ)。
其次，新《醫(yī)院會計制度》為了加強成本核算，對部分會計科目進(jìn)行了變更，使之更能準(zhǔn)確的核算醫(yī)院的收入成本。如新制度規(guī)定固定資產(chǎn)應(yīng)該計提累計折舊，增加了“累計折舊”會計科目，為了核算固定資產(chǎn)報廢、毀損處理等原因轉(zhuǎn)入清理的資產(chǎn)，新增了“固定資產(chǎn)清理”科目，固定資產(chǎn)的殘值和變價收入都通過“固定資產(chǎn)清理”科目核算；又比如為了適應(yīng)新醫(yī)改的要求，對藥品實行零差價銷售，在會計科目上取消了“藥品進(jìn)銷差價”這個科目，醫(yī)院購入的藥品全部按照進(jìn)價銷售；對醫(yī)院發(fā)生的對外投資，借鑒了企業(yè)會計的做法，明確分為長期股權(quán)投資和長期債權(quán)投資等等。這些成本科目的變化使得醫(yī)院的成本核算更加準(zhǔn)確，更能在會計賬面上反映出醫(yī)院真實的成本狀況。
再次，新《醫(yī)院會計制度》加強了對醫(yī)院預(yù)算管理的要求，舊制度下醫(yī)院對預(yù)算的管理不是很嚴(yán)格，財務(wù)部門也沒有對醫(yī)院的預(yù)算引起足夠的重視，每年的預(yù)算編制都基本上是在上年的收入成本的基礎(chǔ)上增加一定的比例簡單的測算，這樣得出的預(yù)算既不準(zhǔn)確也不科學(xué)。新制度規(guī)定醫(yī)院的財務(wù)情況說明要對醫(yī)院預(yù)算情況進(jìn)行說明，也就是說每一項成本項目的預(yù)算都要說明原因，并且與醫(yī)院的實際情況相比較，看成本項目是否合理。同時新會計制度還規(guī)定醫(yī)院要出具科室成本表，同時年底的會計報表還需要注冊會計師的審計，這也就為醫(yī)院的成本核算準(zhǔn)確性提出了更高的要求，促進(jìn)了醫(yī)院成本核算的規(guī)范化。
最后，新《醫(yī)院會計制度》也為醫(yī)院日常的成本核算會計處理提出了更高的要求。以前醫(yī)院的收支業(yè)務(wù)的會計處理并沒有要求明細(xì)到每一個相關(guān)科室，醫(yī)院財務(wù)部門核算收支情況只是一個總賬的概念，
然后經(jīng)過醫(yī)院的核算部門負(fù)責(zé)對醫(yī)院的成本項目進(jìn)行分解，明細(xì)到各個科室，從而核算出醫(yī)院各科室的成本，而新的會計制度要求醫(yī)院每一項收入費用必須明確到各個科室，在會計日常賬務(wù)處理的時候就要把每一項收支項目進(jìn)行明細(xì)處理，這無疑增加了記賬人員的工作強度，因此為了符合新《醫(yī)院會計制度》的規(guī)定，必須借助相關(guān)的會計核算軟件來加強各科室的成本核算，減輕會計人員的工作負(fù)擔(dān)。
新的《醫(yī)院會計制度》的一些新要求為醫(yī)院的成本核算提出了更高的要求，但是有些規(guī)定不是特別明了，也給醫(yī)院的成本核算帶來了一定的影響。
首先，對于會計制度中醫(yī)療收入和應(yīng)收在院病人醫(yī)療款等科目中提到的醫(yī)療服務(wù)，這種服務(wù)成本的確定難度很大，對于涉及現(xiàn)金和銀行存款等的現(xiàn)金流量中的開展醫(yī)療服務(wù)活動收到的現(xiàn)金等，制度上沒有明確加以說明什么屬于醫(yī)療服務(wù)活動，什么不屬于醫(yī)療服務(wù)活動，這就使得在日常的會計處理過程中，會計人員的主管隨意性較大；還有一些成本科目的明細(xì)項目設(shè)置過于籠統(tǒng)，比如醫(yī)療業(yè)務(wù)成本和管理費用的其他也沒有明確說明用法，不利于會計的日常核算。
其次，新《醫(yī)院會計制度》對有些成本項目的規(guī)定缺乏靈活性導(dǎo)致了醫(yī)院成本核算可能不準(zhǔn)確。比如對醫(yī)院固定資產(chǎn)計提累計折舊，醫(yī)院規(guī)定可以采用平均年限法和工作量法計提，但是由于醫(yī)院的固定資產(chǎn)大多是價值比較高的醫(yī)療設(shè)備，而隨著科學(xué)技術(shù)的進(jìn)步，醫(yī)院的醫(yī)療設(shè)備被淘汰的風(fēng)險是很大的，單純的通過直線法或者工作量法無法彌補這種加速折舊的風(fēng)險，如果可以采用加速折舊的方法計提固定資產(chǎn)折舊，就可以盡快的收回成本，也避免了醫(yī)療設(shè)備落后被淘汰的風(fēng)險。
總之，新的《醫(yī)院會計制度》強化了成本核算，使得財務(wù)部門可以從更新的理念和高度重視醫(yī)院的成本核算工作，因此財務(wù)人員應(yīng)該深刻體會新制度中所包含的基本理念和會計處理方法，加強與兄弟單位會計部門和醫(yī)院內(nèi)部相關(guān)科室之間的溝通和協(xié)調(diào)，按照新制度的有關(guān)要求，結(jié)合醫(yī)院的實際情況，制定出一套完整的成本核算體系，以保證醫(yī)院成本核算的真實性和完整性，推進(jìn)醫(yī)院成本核算及時、科學(xué)的開展。
